Szkoła Główna Mikołaja Kopernika rozwija partnerstwa między uczelniami krajowymi, jak i międzynarodowymi. Współpraca międzyuczelniana pozwala na wymianę wiedzy oraz doświadczeń. Podejmowane są różne działania i inicjatywy, które mają na celu wspólne dążenie do rozwoju badań naukowych oraz współpracy na rzecz nauki.
Prodziekan Kolegium Nauk Prawnych SGMK ks. dr Paweł Lewandowski został uhonorowany medalem pamiątkowym Wydziału Prawa Uniwersytetu Trnawskiego w Trnawie w podziękowaniu za rozwijanie współpracy międzynarodowej.
Współpraca naukowa między Szkołą Główną Mikołaja Kopernika oraz Uniwersytetem Trnawski odbywa się w ramach porozumienia podpisanego w Trnavie w dniu 26 września 2024 r.
Uczelnie zorganizowały wspólnie Międzynarodowe Kolokwium Naukowe pt. Current Issues of State-Church Relations – with a Special Focus on Economic Issues (26 września 2024 r.), Międzynarodową Konferencję Naukową pt. Traditional and non-traditional forms of church financing (27 września 2024 r.), Międzynarodowe Kolokwium Naukowe pt. Agreement between the Czech Republic and the Holy See on some legal matters (25 listopada 2024 r.) oraz Międzynarodową Konferencję Naukową pt. Public Funding of Religious Organizations (17 grudnia 2024 r.).
Wszystkie te wydarzenia naukowe odbywały się przy wsparciu finansowym z grantu VEGA 1/0170/21 pn. International Legal Obligations of the Slovak Republic in the Field of Financing of the Catholic Church.